用于納米孔測(cè)序的單細(xì)胞或微量樣本全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組文庫(kù)構(gòu)建方法
基本信息
| 申請(qǐng)?zhí)?/td> | CN202110312522.5 | 申請(qǐng)日 | - |
| 公開(kāi)（公告）號(hào) | CN112853503A | 公開(kāi)（公告）日 | 2021-05-28 |
| 申請(qǐng)公布號(hào) | CN112853503A | 申請(qǐng)公布日 | 2021-05-28 |
| 分類(lèi)號(hào) | C40B50/06(2006.01)I;C12Q1/6869(2018.01)I | 分類(lèi) | - |
| 發(fā)明人 | 鄭洪坤;劉敏;陳鈺萌;張夢(mèng)龍 | 申請(qǐng)（專(zhuān)利權(quán)）人 | 北京百邁客生物科技有限公司 |
| 代理機(jī)構(gòu) | 北京路浩知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 | 代理人 | 商秀玲 |
| 地址 | 101300北京市順義區(qū)南法信鎮(zhèn)順平路南法信段9號(hào)院1幢6層605A | ||
| 法律狀態(tài) | - | ||
摘要
| 摘要 | 本發(fā)明涉及單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)領(lǐng)域，具體涉及用于納米孔測(cè)序的單細(xì)胞或微量樣本全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組文庫(kù)構(gòu)建方法。本發(fā)明提供的文庫(kù)構(gòu)建方法包括：將單細(xì)胞或微量樣本裂解后，采用Smart?seq2方法將mRNA反轉(zhuǎn)錄制備cDNA，以所述cDNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增，將PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行FFPE和末端修復(fù)，再連接納米孔測(cè)序接頭。該方法可以實(shí)現(xiàn)真正的單細(xì)胞測(cè)序，且兼具轉(zhuǎn)錄本覆蓋度高、分辨率高、靈活性強(qiáng)的優(yōu)點(diǎn)，可應(yīng)用于單細(xì)胞的差異基因表達(dá)分析、轉(zhuǎn)錄本結(jié)構(gòu)分析、全長(zhǎng)isoform鑒定等。?? |
