一種納米孔全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組文庫(kù)構(gòu)建方法

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN202110313236.0 申請(qǐng)日 -
公開(kāi)（公告）號(hào) CN113046416A 公開(kāi)（公告）日 2021-06-29
申請(qǐng)公布號(hào) CN113046416A 申請(qǐng)公布日 2021-06-29
分類號(hào) C12Q1/6806（2018.01）I;C12N15/10（2006.01）I;C40B50/06（2006.01）I;C12N15/11（2006.01）I 分類 生物化學(xué)；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學(xué)；酶學(xué)；突變或遺傳工程;
發(fā)明人 鄭洪坤;劉敏;張夢(mèng)龍;陳鈺萌;駱晨;趙國(guó)瑞 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 北京百邁客生物科技有限公司
代理機(jī)構(gòu) 北京路浩知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 商秀玲
地址 101300北京市順義區(qū)南法信鎮(zhèn)順平路南法信段9號(hào)院1幢6層605A
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明涉及轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)領(lǐng)域，具體涉及一種納米孔全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組文庫(kù)構(gòu)建方法。本發(fā)明的文庫(kù)構(gòu)建方法包括：將mRNA富集后，采用SMART技術(shù)將mRNA反轉(zhuǎn)錄制備cDNA，以cDNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增，將PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行FFPE和末端修復(fù)，再連接納米孔測(cè)序接頭。該方法利用SMART技術(shù)構(gòu)建全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組文庫(kù)，文庫(kù)可用于納米孔測(cè)序，對(duì)于讀長(zhǎng)沒(méi)有上限的限制，不需要進(jìn)行長(zhǎng)度選擇，無(wú)需拼接，整個(gè)轉(zhuǎn)錄本可以進(jìn)行單讀長(zhǎng)的端到端測(cè)序，可實(shí)現(xiàn)簡(jiǎn)單、準(zhǔn)確的組裝，并能區(qū)分高度相似的異構(gòu)體、識(shí)別新轉(zhuǎn)錄本以及檢測(cè)融合。