一種三代全長轉(zhuǎn)錄組輔助基因預(yù)測的方法

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN202110322129.4 申請(qǐng)日 -
公開（公告）號(hào) CN113077842A 公開（公告）日 2021-07-06
申請(qǐng)公布號(hào) CN113077842A 申請(qǐng)公布日 2021-07-06
分類號(hào) G16B20/30（2019.01）I;G16B30/10（2019.01）I 分類 物理
發(fā)明人 鄭洪坤;劉福*;李緒明;李婧姬;王晶 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 北京百邁客生物科技有限公司
代理機(jī)構(gòu) 北京路浩知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 錢云
地址 101300北京市順義區(qū)南法信鎮(zhèn)順平路南法信段9號(hào)院1幢6層605A
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明涉及生物信息技術(shù)領(lǐng)域，具體涉及一種三代全長轉(zhuǎn)錄組輔助基因預(yù)測的方法。本發(fā)明所述方法包括利用同源物種的基因信息和二代轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)信息獲取待預(yù)測物種基因組高可靠內(nèi)含子剪切位點(diǎn)；利用所述高可靠內(nèi)含子剪切位點(diǎn)，對(duì)三代全長轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)預(yù)測的內(nèi)含子剪切位點(diǎn)進(jìn)行自動(dòng)化糾正，獲取高可靠性轉(zhuǎn)錄本后進(jìn)行基因結(jié)構(gòu)預(yù)測。本發(fā)明所述方法可實(shí)現(xiàn)可變剪接的預(yù)測，從而利用三代全長轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)對(duì)動(dòng)植物基因組的基因結(jié)構(gòu)在全基因組水平上進(jìn)行高準(zhǔn)確性的預(yù)測。