一種鑒定樣本中腫瘤負(fù)荷的方法和系統(tǒng)

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN201610842333.8 申請(qǐng)日 -
公開（公告）號(hào) CN106367512A 公開（公告）日 2017-02-01
申請(qǐng)公布號(hào) CN106367512A 申請(qǐng)公布日 2017-02-01
分類號(hào) C12Q1/68(2006.01)I;G06F19/22(2011.01)I 分類 生物化學(xué)；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學(xué)；酶學(xué)；突變或遺傳工程;
發(fā)明人 薄世平;梁覃斯;任軍;陸思嘉 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 上海序康醫(yī)療科技有限公司
代理機(jī)構(gòu) 上海一平知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 上海序康醫(yī)療科技有限公司;上海億康醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)所有限公司
地址 201403 上海市奉賢區(qū)金齊路868號(hào)5232室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供了一種鑒定樣本中腫瘤負(fù)荷的方法和系統(tǒng)，具體地，本發(fā)明提供了一種非診斷性地鑒定樣本中腫瘤負(fù)荷的方法，包括步驟：(i)提供一待測(cè)樣本；(ii)對(duì)所述待測(cè)樣本進(jìn)行測(cè)序，從而獲得所述樣本的基因組序列；(iii)將步驟(ii)獲得的基因組序列與參考基因組進(jìn)行比對(duì)，從而獲得基因組序列在參考基因組上的位置信息；(iv)將所述的參考基因組分成M個(gè)區(qū)域片段，其中每個(gè)區(qū)域片段為一個(gè)窗口b，計(jì)算每個(gè)窗口b的拷貝數(shù)；(v)對(duì)步驟(iv)的每個(gè)窗口b進(jìn)行Z檢驗(yàn)，從而計(jì)算每個(gè)窗口b的Z值；和(vi)根據(jù)步驟(v)所得到的Z值，計(jì)算基因組混亂度(GAS)，基于基因組混亂度的數(shù)值鑒定所述待測(cè)樣本中的腫瘤負(fù)荷。本發(fā)明的方法和系統(tǒng)可提高腫瘤檢測(cè)的靈敏性和通用性。