一種轉(zhuǎn)錄本的分類方法

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN201910388054.2 申請(qǐng)日 -
公開(公告)號(hào) CN111916147A 公開(公告)日 2020-11-10
申請(qǐng)公布號(hào) CN111916147A 申請(qǐng)公布日 2020-11-10
分類號(hào) G16B20/00(2019.01)I;G16B30/10(2019.01)I 分類 物理
發(fā)明人 封力;湯冬;王毓博;李凈凈;梁帆;胡江;汪德鵬 申請(qǐng)(專利權(quán))人 武漢希望組生物科技有限公司
代理機(jī)構(gòu) 武漢河山金堂專利事務(wù)所(普通合伙) 代理人 胡清堂
地址 430000 湖北省武漢市東湖新技術(shù)開發(fā)區(qū)花城大道8號(hào)武漢軟件新城2期C11棟19層01號(hào)
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明屬于生物技術(shù)信息領(lǐng)域,具體涉及一種轉(zhuǎn)錄本分類方法,該方法是通過準(zhǔn)確定位剪切位點(diǎn)對(duì)轉(zhuǎn)錄本進(jìn)行分類,具體包括以下步驟:對(duì)測(cè)序所得全長轉(zhuǎn)錄本結(jié)果質(zhì)控,獲得高質(zhì)量全長轉(zhuǎn)錄本;將高質(zhì)量全長轉(zhuǎn)錄本與參考基因組比對(duì),獲得相同基因模型下的所有轉(zhuǎn)錄本信息,去冗余,一個(gè)基因模型下的一種剪切模式只保留唯一最長的轉(zhuǎn)錄本;根據(jù)剪切位點(diǎn),對(duì)全長轉(zhuǎn)錄本進(jìn)行分類,獲得初步分類結(jié)果;過濾初步分類結(jié)果,獲得最終分類結(jié)果。該方法分類準(zhǔn)確,假陽性率很低,適用性廣泛,有效解決了現(xiàn)有技術(shù)不準(zhǔn)確、分類不理想的缺陷。??