一種對(duì)組裝序列排序的方法及系統(tǒng)

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201910270433.1 申請日 -
公開（公告）號(hào) CN110020726A 公開（公告）日 2019-07-16
申請公布號(hào) CN110020726A 申請公布日 2019-07-16
分類號(hào) G06N3/12;G06K9/62 分類 計(jì)算；推算；計(jì)數(shù);
發(fā)明人 李凈凈;易嘉成;胡江;汪德鵬 申請（專利權(quán)）人 武漢希望組生物科技有限公司
代理機(jī)構(gòu) 北京集佳知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 武漢未來組生物科技有限公司
地址 430000 湖北省武漢市東湖新技術(shù)開發(fā)區(qū)花城大道8號(hào)武漢軟件新城2期C11棟19層01號(hào)
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種對(duì)組裝序列排序的方法及系統(tǒng)，該方法包括：對(duì)DNA測序片段進(jìn)行組裝后的目標(biāo)重疊群進(jìn)行切分處理，獲得目標(biāo)數(shù)據(jù)；對(duì)目標(biāo)數(shù)據(jù)進(jìn)行定向和排序處理，獲得若干個(gè)排列結(jié)果；計(jì)算每種排列結(jié)果的交聯(lián)信號(hào)值的離散程度，并計(jì)算獲得目標(biāo)數(shù)據(jù)中的切分序列的掛載率，切分序列表征對(duì)重疊群按照預(yù)設(shè)切分長度進(jìn)行切分后的序列；依據(jù)離散程度和掛載率，確定初始排列結(jié)果；將初始排列結(jié)果進(jìn)行互作熱圖驗(yàn)證，若滿足預(yù)設(shè)驗(yàn)證條件，則將初始排列結(jié)果確定為目標(biāo)排列結(jié)果，若不滿足，則對(duì)初始排列結(jié)果進(jìn)行調(diào)整，獲得目標(biāo)排列結(jié)果。通過本發(fā)明解決了現(xiàn)有技術(shù)排序不準(zhǔn)確的問題及可以實(shí)現(xiàn)對(duì)有明顯組裝錯(cuò)誤的重疊組進(jìn)行糾錯(cuò)。