一種基于宏基因組學的病原微生物檢測方法及裝置

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202111291817.5 申請日 -
公開（公告）號 CN113744807A 公開（公告）日 2021-12-03
申請公布號 CN113744807A 申請公布日 2021-12-03
分類號 G16B30/10（2019.01）I;G16B30/20（2019.01）I 分類 物理
發(fā)明人 蓋偉;李瑞琳;關尚京 申請（專利權(quán)）人 微巖醫(yī)學科技（北京）有限公司
代理機構(gòu) 北京集佳知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 張影
地址 100176北京市大興區(qū)北京經(jīng)濟技術(shù)開發(fā)區(qū)經(jīng)海四路156號院11號樓2層A區(qū)001室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種基于宏基因組學的病原微生物檢測方法及裝置，包括：獲取待檢測樣本的宏基因組測序數(shù)據(jù)；對宏基因組測序數(shù)據(jù)進行預處理，得到目標數(shù)據(jù)；對目標數(shù)據(jù)進行篩選，得到目標序列；對目標序列進行聚類分析，獲得待測樣本的候選物種類別；將目標數(shù)據(jù)與非冗余參考基因集進行比對，并計算每個基因在單個樣本中的豐度，得到待測樣本的目標物種分類信息；將目標數(shù)據(jù)與病原微生物可檢測數(shù)據(jù)庫中的信息進行比對，獲得待測樣本的耐藥基因和毒性元件信息；將目標物種分類信息、耐藥基因和毒性元件信息，確定為待檢測樣本的檢測結(jié)果。本發(fā)明提升了病原微生物檢測適用性范圍和病原檢測準確性。