計算基因型對表型額外貢獻(xiàn)的方法及裝置

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201710669992.0 申請日 -
公開(公告)號 CN107315922B 公開(公告)日 2017-11-03
申請公布號 CN107315922B 申請公布日 2017-11-03
分類號 G16B20/20(2019.01)I 分類 -
發(fā)明人 朱天生;范嘉庚;劉艷波 申請(專利權(quán))人 杭州祥音醫(yī)學(xué)檢驗實驗室有限公司
代理機(jī)構(gòu) 北京超凡宏宇專利代理事務(wù)所(特殊普通合伙) 代理人 杭州祥音醫(yī)學(xué)檢驗實驗室有限公司
地址 311200浙江省杭州市蕭山區(qū)蕭山經(jīng)濟(jì)技術(shù)開發(fā)區(qū)鴻興路111號5號樓4樓
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供了計算基因型對表型額外貢獻(xiàn)的方法及裝置,涉及生物信息學(xué)技術(shù)領(lǐng)域,其中,該計算基因型對表型額外貢獻(xiàn)的方法包括:首先,通過權(quán)威文獻(xiàn)及生物數(shù)據(jù)庫獲取基因多態(tài)性位點(diǎn)信息,其中,基因多態(tài)性位點(diǎn)信息包括表型、基因型、基因頻率和OR值,之后,按照基因多態(tài)性位點(diǎn)信息對應(yīng)的表型將物種細(xì)分為多個亞類,接著,根據(jù)基因頻率和OR值計算每種亞類中各個基因型的平均貢獻(xiàn)值,然后,對單個待測試物種進(jìn)行基因多態(tài)性位點(diǎn)檢測,獲取待測試物種的特定基因型,最后,根據(jù)OR值和平均貢獻(xiàn)值計算特定基因型的對表型額外貢獻(xiàn)值,通過上述方法能夠方便快捷的計算出基因型對表型的額外貢獻(xiàn)。??