基于機(jī)器學(xué)習(xí)篩選細(xì)菌耐藥表型相關(guān)重要特征基因的方法

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN202111400540.5 申請(qǐng)日 -
公開(kāi)（公告）號(hào) CN114067912A 公開(kāi)（公告）日 2022-02-18
申請(qǐng)公布號(hào) CN114067912A 申請(qǐng)公布日 2022-02-18
分類號(hào) G16B30/10（2019.01）I;G16B30/20（2019.01）I;G16B50/00（2019.01）I;G16B40/00（2019.01）I;G16H70/40（2018.01）I;G06N20/00（2019.01）I 分類 物理
發(fā)明人 韓朋;饒冠華;高建鵬;陳方媛;蔣智 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 天津金匙醫(yī)學(xué)科技有限公司
代理機(jī)構(gòu) 北京知匯林知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所（普通合伙） 代理人 董濤
地址 301799天津市武清區(qū)武清開(kāi)發(fā)區(qū)福源道北側(cè)創(chuàng)業(yè)總部基地B21號(hào)樓901室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本申請(qǐng)涉及一種基于機(jī)器學(xué)習(xí)技術(shù)篩選細(xì)菌耐藥表型相關(guān)重要特征基因的方法，該方法針對(duì)細(xì)菌抗生素耐藥表型，基于BGWAS思想搜集公共平臺(tái)上目標(biāo)細(xì)菌基因組或者現(xiàn)行收集測(cè)序組裝后得到的大樣本量菌株基因組數(shù)據(jù)及其對(duì)應(yīng)的抗生素藥物藥敏測(cè)試結(jié)果，使用機(jī)器學(xué)習(xí)方法進(jìn)行基因型與耐藥表型兩者間關(guān)聯(lián)分析，以篩選出與耐藥表型相關(guān)的重要特征基因（非核心耐藥基因），同時(shí)得到重要特征基因的權(quán)重系數(shù)，最后使用ROC分析確定各藥物相關(guān)耐藥基因可靠性。