測(cè)序深度的矯正方法及裝置

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN201811614819.1 申請(qǐng)日 -
公開（公告）號(hào) CN109727638B 公開（公告）日 2021-08-17
申請(qǐng)公布號(hào) CN109727638B 申請(qǐng)公布日 2021-08-17
分類號(hào) G16B20/30 分類 物理
發(fā)明人 張靜波;柴景超;伍啟熹;王建偉;劉倩;劉珂弟;唐宇 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 北京優(yōu)迅醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室有限公司
代理機(jī)構(gòu) 北京康信知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限責(zé)任公司 代理人 江舟;王曉婷
地址 100195 北京市海淀區(qū)四季青杏石口路65號(hào)益園C區(qū)C7
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供了一種測(cè)序深度的矯正方法及裝置，其中，上述裝置包括：獲取模塊，用于獲取基因組上每個(gè)位點(diǎn)的GC含量，以及所述基因組的所有位點(diǎn)的測(cè)序深度；劃分模塊，用于根據(jù)每個(gè)位點(diǎn)的GC含量將所述所有位點(diǎn)按照指定規(guī)則分成N個(gè)不同區(qū)間，其中，N為正整數(shù)；確定模塊，用于確定每個(gè)區(qū)間內(nèi)位點(diǎn)的區(qū)間平均深度的第一泊松分布律，以及N個(gè)區(qū)間的平均測(cè)序深度的第二泊松分布律；還用于根據(jù)所述第一泊松分布律和所述第二泊松分布律確定所述每個(gè)區(qū)間內(nèi)不同測(cè)序深度的權(quán)重；處理模塊，用于針對(duì)所述基因組的每個(gè)位點(diǎn)，分別將測(cè)序深度與每個(gè)測(cè)序深度對(duì)應(yīng)的權(quán)重相乘，得到矯正后的每個(gè)位點(diǎn)的測(cè)序深度。