測序深度的矯正方法及裝置

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201811616167.5 申請日 -
公開（公告）號 CN109767813A 公開（公告）日 2021-06-22
申請公布號 CN109767813A 申請公布日 2021-06-22
分類號 G16B30/00 分類 物理
發(fā)明人 柴景超;張靜波;伍啟熹;王建偉;劉倩;劉珂弟;唐宇 申請（專利權(quán)）人 北京優(yōu)迅醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室有限公司
代理機(jī)構(gòu) 北京康信知識產(chǎn)權(quán)代理有限責(zé)任公司 代理人 江舟;王曉婷
地址 100195 北京市海淀區(qū)四季青杏石口路65號益園C區(qū)C7
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供了一種測序深度的矯正方法及裝置，其中，上述裝置包括：獲取模塊，用于獲取基因組上每個(gè)位點(diǎn)的GC含量，以及基因組的所有位點(diǎn)的測序深度；劃分模塊，用于根據(jù)每個(gè)位點(diǎn)的GC含量將所有位點(diǎn)按照指定規(guī)則分成N個(gè)不同區(qū)間，其中，N為正整數(shù)；第一處理模塊，用于針對每個(gè)區(qū)間內(nèi)的每個(gè)位點(diǎn)的測序深度Dij進(jìn)行轉(zhuǎn)換處理，得到第一值；確定N個(gè)區(qū)間的平均測序深度的泊松分布，并對泊松分布的值進(jìn)行與測序深度Dij同樣的轉(zhuǎn)換處理，得到第二值；第二處理模塊，用于針對每個(gè)區(qū)間，分別確定第一值的均值mi1以及第二值的均值mi2；根據(jù)第一值，mi1和mi2確定第三值；確定模塊，用于對第三值進(jìn)行轉(zhuǎn)換處理對應(yīng)的反轉(zhuǎn)換處理，得到矯正后的每個(gè)位點(diǎn)的測序深度。