病原微生物分析鑒定系統(tǒng)及應(yīng)用
基本信息
申請(qǐng)?zhí)?/td> | CN202010281509.3 | 申請(qǐng)日 | - |
公開(kāi)(公告)號(hào) | CN111462821B | 公開(kāi)(公告)日 | 2022-02-22 |
申請(qǐng)公布號(hào) | CN111462821B | 申請(qǐng)公布日 | 2022-02-22 |
分類號(hào) | G16B30/00 | 分類 | 物理 |
發(fā)明人 | 許騰;陳文景;張麗珍;劉足;潘秀瑩;曾偉奇;秦璐;李永軍;王小銳;蘇杭 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人 | 廣州微遠(yuǎn)醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室有限公司 |
代理機(jī)構(gòu) | 廣州新諾專利商標(biāo)事務(wù)所有限公司 | 代理人 | 李海恬 |
地址 | 510130 廣東省廣州市高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)開(kāi)發(fā)區(qū)科豐路31號(hào)自編三棟華南新材料創(chuàng)新園G10棟301號(hào) | ||
法律狀態(tài) | - |
摘要
摘要 | 本發(fā)明涉及一種病原微生物分析鑒定系統(tǒng)及應(yīng)用,屬于基因檢測(cè)分析技術(shù)領(lǐng)域。該病原微生物分析鑒定系統(tǒng)包括:數(shù)據(jù)獲取模塊:用于獲取高通量測(cè)序得到的基因測(cè)序數(shù)據(jù);數(shù)據(jù)過(guò)濾模塊:用于將依次進(jìn)行低質(zhì)量序列過(guò)濾、宿主序列過(guò)濾;數(shù)據(jù)比對(duì)模塊:用于將序列比對(duì)至病原微生物基因組數(shù)據(jù)庫(kù)中;物種比對(duì)模塊:用于統(tǒng)計(jì)待分析序列;數(shù)據(jù)分析模塊:用于計(jì)算共有比對(duì)序列集中各序列對(duì)比上每一個(gè)物種的相似度S和平均相似度值SMSi;物種序列模塊:用于計(jì)算物種的總比對(duì)序列數(shù)SNTi;結(jié)果輸出模塊:用于進(jìn)行生物信息學(xué)分析,得到病原微生物分析鑒定結(jié)果。該病原微生物分析鑒定系統(tǒng)不僅具有分析時(shí)間短、準(zhǔn)確性高的優(yōu)點(diǎn);還可準(zhǔn)確得檢測(cè)混合感染,獲得具體病原體信息。 |
