判斷背景引入微生物序列的方法及其應用

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202110466665.1 申請日 -
公開（公告）號 CN113270145B 公開（公告）日 2022-05-06
申請公布號 CN113270145B 申請公布日 2022-05-06
分類號 G16B30/10（2019.01）I;G16B40/20（2019.01）I;G16B40/30（2019.01）I;G16B50/00（2019.01）I 分類 物理
發(fā)明人 許騰;何福生;李曉蕾;謝淑媚;王小銳;李永軍;蘇杭 申請（專利權）人 廣州微遠醫(yī)學檢驗實驗室有限公司
代理機構 廣州新諾專利商標事務所有限公司 代理人 李海恬
地址 510130廣東省廣州市高新技術產業(yè)開發(fā)區(qū)科豐路31號自編三棟華南新材料創(chuàng)新園G10棟303號
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明涉及一種判斷背景引入微生物序列的方法及其應用，屬于生物信息分析技術領域。該方法包括以下步驟：確定背景微生物列表：取若干病原微生物陰性樣本，將各微生物豐度的定量值A與核酸總量D進行相關性檢驗，呈負相關則判定為背景病原微生物；判斷模型建立：分別取背景病原微生物的陰性對照樣本集和陽性樣本集，將背景病原微生物基因序列數據比對至該微生物的特征序列區(qū)域，計算豐度，建立判斷模型；微生物特異性區(qū)域定量分析：獲取待測樣本中背景病原微生物基因序列數據，采用上述判斷模型進行判斷。該方法能夠準確判斷測序所得微生物序列是否為背景引入，且可降低批次假陽或者假陰問題，可廣泛應用于病原微生物檢測的數據分析中。