一種利用Hi-C進行多倍體魚類的染色體構(gòu)建方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202010226516.3 申請日 -
公開(公告)號 CN111445948A 公開(公告)日 2020-07-24
申請公布號 CN111445948A 申請公布日 2020-07-24
分類號 G16B20/10(2019.01)I 分類 -
發(fā)明人 袁曉輝;劉海平;肖世俊 申請(專利權(quán))人 武漢古奧基因科技有限公司
代理機構(gòu) 沈陽東大知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 武漢古奧基因科技有限公司
地址 430070湖北省武漢市洪山區(qū)珞獅路122號武漢理工大學(xué)孵化樓B座15樓
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 一種利用Hi?C進行多倍體魚類的染色體構(gòu)建方法,所屬分子生物學(xué)技術(shù)領(lǐng)域,具體由以下步驟完成:1)根據(jù)序列之間的重疊群構(gòu)建出contig;2)基于全基因組比對拆分亞基因組;3)Hi?C文庫構(gòu)建及其測序;4)Hi?C構(gòu)建染色體序列。本發(fā)明方法根據(jù)亞基因組的組裝和Hi?C結(jié)合,只需要已經(jīng)有初步組裝的多倍體基因組,就可以得到染色體序列,為多倍體魚類的染色體的組裝提供了一種有效方法,為多倍體魚類的功能基因組研究,遺傳育種,發(fā)育進化提供了一種切實可行的技術(shù)。??