一種利用全基因組比對拆分四倍體魚類亞基因組的方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202010226473.9 申請日 -
公開（公告）號 CN111445953A 公開（公告）日 2020-07-24
申請公布號 CN111445953A 申請公布日 2020-07-24
分類號 G16B30/10(2019.01)I;G16B40/00(2019.01)I 分類 -
發(fā)明人 袁曉輝;劉海平;肖世俊 申請（專利權）人 武漢古奧基因科技有限公司
代理機構 沈陽東大知識產(chǎn)權代理有限公司 代理人 武漢古奧基因科技有限公司
地址 430070湖北省武漢市洪山區(qū)珞獅路122號武漢理工大學孵化樓B座15樓
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 一種利用全基因組比對拆分四倍體魚類亞基因組的方法，所屬分子生物學技術領域，具體由以下步驟完成：1)Lastz全基因組比對；2)比對結果連鎖，共線性化；3)重復比對序列處理；4)全局比對結果聚類，拆分多倍體為R1和R2；5)多倍體拆分結果的評估。本發(fā)明方法無需要亞基因組測序，只需要已經(jīng)有初步組裝的多倍體基因組，該方法可以拆分90％以上的亞基因組序列，只需要3天的數(shù)據(jù)處理時間，該方法結果準確，多倍體魚類的亞基因組研究，繼而的功能基因組研究，遺傳育種，發(fā)育進化提供了一種切實可行的技術。??