一種利用納米孔測(cè)序的轉(zhuǎn)錄組分析方法

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN202010226519.7 申請(qǐng)日 -
公開(kāi)(公告)號(hào) CN111292806A 公開(kāi)(公告)日 2020-06-16
申請(qǐng)公布號(hào) CN111292806A 申請(qǐng)公布日 2020-06-16
分類(lèi)號(hào) G16B30/10(2019.01)I;G16B40/00(2019.01)I 分類(lèi) -
發(fā)明人 袁曉輝;劉海平;肖世俊 申請(qǐng)(專(zhuān)利權(quán))人 武漢古奧基因科技有限公司
代理機(jī)構(gòu) 沈陽(yáng)東大知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 武漢古奧基因科技有限公司
地址 430070湖北省武漢市洪山區(qū)珞獅路122號(hào)武漢理工大學(xué)孵化樓B座15樓
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 一種利用納米孔測(cè)序的轉(zhuǎn)錄組分析方法,所屬分子生物學(xué)技術(shù)領(lǐng)域,本發(fā)明公開(kāi)了一種利用nanopore測(cè)序數(shù)據(jù)的轉(zhuǎn)錄組分析方法,包括基于minimap2快速比對(duì)獲得序列之間的關(guān)系;計(jì)算序列之間比對(duì)的相似性、覆蓋度、最大缺失、最大插入;利用CARNAC?LR軟件進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)狀聚類(lèi),獲得序列網(wǎng)絡(luò)狀關(guān)系;將聚類(lèi)得到的cluster經(jīng)過(guò)pbccs軟件糾錯(cuò)而獲得CCS序列;本發(fā)明方法通過(guò)獲得高質(zhì)量的CCS序列之后,可以進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組后續(xù)的基因定量等分析。??