一種利用納米孔測(cè)序的轉(zhuǎn)錄組分析方法
基本信息
申請(qǐng)?zhí)?/td> | CN202010226519.7 | 申請(qǐng)日 | - |
公開(kāi)(公告)號(hào) | CN111292806A | 公開(kāi)(公告)日 | 2020-06-16 |
申請(qǐng)公布號(hào) | CN111292806A | 申請(qǐng)公布日 | 2020-06-16 |
分類(lèi)號(hào) | G16B30/10(2019.01)I;G16B40/00(2019.01)I | 分類(lèi) | - |
發(fā)明人 | 袁曉輝;劉海平;肖世俊 | 申請(qǐng)(專(zhuān)利權(quán))人 | 武漢古奧基因科技有限公司 |
代理機(jī)構(gòu) | 沈陽(yáng)東大知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 | 代理人 | 武漢古奧基因科技有限公司 |
地址 | 430070湖北省武漢市洪山區(qū)珞獅路122號(hào)武漢理工大學(xué)孵化樓B座15樓 | ||
法律狀態(tài) | - |
摘要
摘要 | 一種利用納米孔測(cè)序的轉(zhuǎn)錄組分析方法,所屬分子生物學(xué)技術(shù)領(lǐng)域,本發(fā)明公開(kāi)了一種利用nanopore測(cè)序數(shù)據(jù)的轉(zhuǎn)錄組分析方法,包括基于minimap2快速比對(duì)獲得序列之間的關(guān)系;計(jì)算序列之間比對(duì)的相似性、覆蓋度、最大缺失、最大插入;利用CARNAC?LR軟件進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)狀聚類(lèi),獲得序列網(wǎng)絡(luò)狀關(guān)系;將聚類(lèi)得到的cluster經(jīng)過(guò)pbccs軟件糾錯(cuò)而獲得CCS序列;本發(fā)明方法通過(guò)獲得高質(zhì)量的CCS序列之后,可以進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組后續(xù)的基因定量等分析。?? |
