一種檢測分析幽門螺旋桿菌的毒性及致病性的方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201810970602.8 申請日 -
公開(公告)號 CN109182564B 公開(公告)日 2021-05-25
申請公布號 CN109182564B 申請公布日 2021-05-25
分類號 C12R1/01(2006.01)N;C12Q1/04(2006.01)I;C12Q1/689(2018.01)I 分類 -
發(fā)明人 郜恒駿;華友佳;陳傲君 申請(專利權(quán))人 上海芯超生物科技有限公司
代理機(jī)構(gòu) 上海市匯業(yè)律師事務(wù)所 代理人 王函
地址 201203 上海市浦東新區(qū)李冰路151號5號樓4樓
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開一種檢測分析幽門螺旋桿菌的毒性及致病性的方法,包括:對幽門螺旋桿菌目標(biāo)菌株進(jìn)行DNA提取和全基因組序列檢測,根據(jù)全基因組序列檢測的結(jié)果進(jìn)行全基因組測序數(shù)據(jù)數(shù)據(jù)分析和致病相關(guān)基因特異性分析;1)對所述致病相關(guān)基因進(jìn)行分型分類;2)根據(jù)全基因組序列檢測的結(jié)果統(tǒng)計(jì)致病相關(guān)基因的reads數(shù);3)將重要分型基因分別統(tǒng)計(jì)比對到各自參考序列的百分比;4)對重要分型基因進(jìn)行分型判定,對其他致病相關(guān)基因進(jìn)行功能完整度判定;5)根據(jù)上述判定結(jié)果,對重要分型基因和其他致病相關(guān)基因判斷其毒性、功能完整性及功能意義解讀。本發(fā)明對深入理解Hp致病機(jī)制及指導(dǎo)Hp感染患者個(gè)性化治療,對臨床研究和教學(xué)都有非常重大的意義。??