一種適用于Sequel測序的三代全長轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果分析方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202010823703.X 申請日 -
公開（公告）號 CN112086128A 公開（公告）日 2020-12-15
申請公布號 CN112086128A 申請公布日 2020-12-15
分類號 G16B20/30(2019.01)I;G16B50/00(2019.01)I 分類 物理
發(fā)明人 沈立;姜麗榮;孫子奎 申請（專利權(quán)）人 南京派森諾基因科技有限公司
代理機構(gòu) 上海天翔知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 南京派森諾基因科技有限公司
地址 211800江蘇省南京市江北新區(qū)浦濱路211號揚子科創(chuàng)中心A棟24層2401室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種適用于Sequel測序平臺的三代全長轉(zhuǎn)錄組分析方法，其特征在于，包括如下步驟：步驟一，測序數(shù)據(jù)過濾步驟；步驟二，測序數(shù)據(jù)比對步驟；步驟三，轉(zhuǎn)錄本注釋步驟；步驟四，ORF預測步驟；步驟五，轉(zhuǎn)錄本功能注釋步驟；步驟六，融合基因分析步驟；步驟七，LncRNA預測步驟；步驟八，可變剪切分析步驟；步驟九，可變多聚腺苷酸化分析步驟。本發(fā)明的運行速度更快，且與常用的matchannot軟件相比對轉(zhuǎn)錄本的注釋更加精細，更加便于分析轉(zhuǎn)錄本的類型。??