一種基于無參考基因組的群體進(jìn)化分析方法
基本信息
| 申請(qǐng)?zhí)?/td> | CN202010768331.5 | 申請(qǐng)日 | - |
| 公開（公告）號(hào) | CN112164424A | 公開（公告）日 | 2021-01-01 |
| 申請(qǐng)公布號(hào) | CN112164424A | 申請(qǐng)公布日 | 2021-01-01 |
| 分類號(hào) | G16B40/00(2019.01)I | 分類 | 物理 |
| 發(fā)明人 | 劉書云;張海煥;姜麗榮;孫子奎 | 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 | 南京派森諾基因科技有限公司 |
| 代理機(jī)構(gòu) | 上海天翔知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 | 代理人 | 南京派森諾基因科技有限公司 |
| 地址 | 211800江蘇省南京市江北新區(qū)浦濱路211號(hào)揚(yáng)子科創(chuàng)中心A棟24層2401室 | ||
| 法律狀態(tài) | - | ||
摘要
| 摘要 | 本發(fā)明公開了一種基于2d?RAD測(cè)序后無參考基因組的群體進(jìn)化分析方法，通過將樣本進(jìn)行數(shù)據(jù)拆分后過濾聚類得到群體SNP，并基于樣本分組和群體SNP信息進(jìn)行群體遺傳參數(shù)分析后構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹，確定最佳K值后利用所述R自寫腳本，根據(jù)群體SNP信息和指定的群體信息來尋找兩大Group之間的共有和特有SNP信息進(jìn)行無參考基因組的群體進(jìn)化分析。本發(fā)明的整個(gè)數(shù)據(jù)分析比較自動(dòng)化，節(jié)省了人力成本，提高了分析效率，避免了可能的人為失誤且分析的數(shù)據(jù)圖表更加美觀。?? |
