病原微生物毒力基因關(guān)聯(lián)模型及其建立方法和應(yīng)用
基本信息
| 申請(qǐng)?zhí)?/td> | CN202110055186.0 | 申請(qǐng)日 | - |
| 公開(kāi)（公告）號(hào) | CN112837745A | 公開(kāi)（公告）日 | 2021-05-25 |
| 申請(qǐng)公布號(hào) | CN112837745A | 申請(qǐng)公布日 | 2021-05-25 |
| 分類號(hào) | G16B20/00;G16B50/00 | 分類 | 物理 |
| 發(fā)明人 | 許騰;何福生;張俊杰;曾偉奇;李曉蕾;茍雪靜;李永軍;王小銳;蘇杭 | 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 | 深圳微遠(yuǎn)醫(yī)療科技有限公司 |
| 代理機(jī)構(gòu) | 廣州新諾專利商標(biāo)事務(wù)所有限公司 | 代理人 | 李海恬 |
| 地址 | 510130 廣東省廣州市高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)開(kāi)發(fā)區(qū)科豐路31號(hào)自編三棟華南新材料創(chuàng)新園G10棟303號(hào) | ||
| 法律狀態(tài) | - | ||
摘要
| 摘要 | 本發(fā)明涉及一種病原微生物毒力基因關(guān)聯(lián)模型及其建立方法和應(yīng)用，屬于基因檢測(cè)技術(shù)領(lǐng)域。該方法包括以下步驟：建立病原微生物基因數(shù)據(jù)庫(kù)和毒力基因數(shù)據(jù)庫(kù)；獲取臨床樣本的病原微生物宏基因組測(cè)序數(shù)據(jù)，得到每個(gè)臨床樣本中病原微生物和所對(duì)應(yīng)的毒力基因序列數(shù)據(jù)；對(duì)上述病原微生物的序列數(shù)據(jù)和毒力基因序列數(shù)據(jù)進(jìn)行聚類分析，獲得單個(gè)毒力基因與至少一個(gè)疑似關(guān)聯(lián)病原微生物的正態(tài)分布模型，選取其中病原微生物豐度高且毒力基因序列數(shù)與病原微生物序列數(shù)強(qiáng)相關(guān)的模型，即得。采用該方法得到的病原微生物毒力基因關(guān)聯(lián)模型，能夠判斷每種毒力基因究竟來(lái)源于哪種細(xì)菌，彌補(bǔ)了現(xiàn)有技術(shù)的缺陷，且具有適用范圍廣、準(zhǔn)確性高的優(yōu)點(diǎn)。 |
