基于質(zhì)譜分析的肽譜存留時(shí)間預(yù)測(cè)方法及系統(tǒng)

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN202111076063.1 申請(qǐng)日 -
公開（公告）號(hào) CN113936742A 公開（公告）日 2022-01-14
申請(qǐng)公布號(hào) CN113936742A 申請(qǐng)公布日 2022-01-14
分類號(hào) G16B40/10（2019.01）I;G16B20/00（2019.01）I;G06N3/04（2006.01）I;G01N27/62（2021.01）I 分類 物理
發(fā)明人 阮宏強(qiáng);張鵬;劉泰驛 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 上海中科新生命生物科技有限公司
代理機(jī)構(gòu) 北京科億知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所（普通合伙） 代理人 肖平安
地址 201109上海市閔行區(qū)園美路58號(hào)1幢15樓
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供一種基于質(zhì)譜分析的肽譜存留時(shí)間預(yù)測(cè)方法及系統(tǒng)，包括：將譜圖庫中的肽段序列及肽段序列對(duì)應(yīng)的保留時(shí)間轉(zhuǎn)換為（肽段序列,保留時(shí)間）格式；將肽段序列按照氨基酸序列表進(jìn)行轉(zhuǎn)換得到肽段序列矩陣；構(gòu)建雙向循環(huán)神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型：其中循環(huán)神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)單細(xì)胞結(jié)構(gòu)保存肽段序列矩陣及其對(duì)應(yīng)的保留時(shí)間；遺忘門確認(rèn)肽段序列矩陣是否保留；輸入門根據(jù)遺忘門確認(rèn)的結(jié)果更新肽段序列矩陣對(duì)應(yīng)的保留時(shí)間；輸出門輸出更新后的肽段序列矩陣及對(duì)應(yīng)的保留時(shí)間。通過對(duì)修飾成分進(jìn)行編碼，使得修飾成分對(duì)肽段序列存留時(shí)間的影響被考慮；同時(shí)通過雙向循環(huán)神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型，使得對(duì)肽段序列的存留時(shí)間的預(yù)測(cè)分析結(jié)果可靠。解決了如何準(zhǔn)確預(yù)測(cè)肽譜的存留時(shí)間的問題。