一種檢測分析幽門螺旋桿菌的毒性及致病性的方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201810970602.8 申請日 -
公開（公告）號 CN109182564A 公開（公告）日 2019-01-11
申請公布號 CN109182564A 申請公布日 2019-01-11
分類號 C12Q1/689;C12Q1/04;C12R1/01 分類 生物化學(xué)；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學(xué)；酶學(xué)；突變或遺傳工程;
發(fā)明人 郜恒駿;華友佳;陳傲君 申請（專利權(quán)）人 上海芯超醫(yī)學(xué)檢驗所有限公司
代理機構(gòu) 上海浦一知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 上海芯超醫(yī)學(xué)檢驗所有限公司
地址 201318 上海市浦東新區(qū)紫萍路908弄15號
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開一種檢測分析幽門螺旋桿菌的毒性及致病性的方法，包括：對幽門螺旋桿菌目標菌株進行DNA提取和全基因組序列檢測，根據(jù)全基因組序列檢測的結(jié)果進行全基因組測序數(shù)據(jù)數(shù)據(jù)分析和致病相關(guān)基因特異性分析；1)對所述致病相關(guān)基因進行分型分類；2)根據(jù)全基因組序列檢測的結(jié)果統(tǒng)計致病相關(guān)基因的reads數(shù)；3)將重要分型基因分別統(tǒng)計比對到各自參考序列的百分比；4)對重要分型基因進行分型判定，對其他致病相關(guān)基因進行功能完整度判定；5)根據(jù)上述判定結(jié)果，對重要分型基因和其他致病相關(guān)基因判斷其毒性、功能完整性及功能意義解讀。本發(fā)明對深入理解Hp致病機制及指導(dǎo)Hp感染患者個性化治療，對臨床研究和教學(xué)都有非常重大的意義。