預(yù)測(cè)/驗(yàn)證多酚類化合物激活劑對(duì)Sirtuin與煙酰胺腺嘌呤結(jié)合效果影響的方法

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN202110006987.8 申請(qǐng)日 -
公開（公告）號(hào) CN112669900A 公開（公告）日 2021-04-16
申請(qǐng)公布號(hào) CN112669900A 申請(qǐng)公布日 2021-04-16
分類號(hào) G16B15/00;G16C20/20 分類 物理
發(fā)明人 黃易寒;李駿;湯小蘇 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 杭州諾莘科技有限責(zé)任公司
代理機(jī)構(gòu) 杭州天勤知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 胡紅娟
地址 311400 浙江省杭州市富陽區(qū)銀湖街道高爾夫路83號(hào)第六幢三樓305室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種預(yù)測(cè)/驗(yàn)證多酚類化合物激活劑對(duì)Sirtuin與煙酰胺腺嘌呤(NAD+)結(jié)合效果影響的方法，利用一系列對(duì)復(fù)合體系的計(jì)算處理和副本交換分子動(dòng)力學(xué)模擬，Sirtuin/NAD+復(fù)合物結(jié)構(gòu)和Sirtuin/激活劑/NAD+復(fù)合物結(jié)構(gòu)可實(shí)現(xiàn)全局優(yōu)化并得到穩(wěn)態(tài)構(gòu)型。在此基礎(chǔ)上對(duì)兩種復(fù)合物體系進(jìn)行結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性比較、殘基穩(wěn)定性比較和NAD+與Sirtuin的結(jié)合能比較，預(yù)測(cè)/驗(yàn)證激活劑對(duì)NAD+與Sirtuin結(jié)合效果的影響。相比實(shí)驗(yàn)方法，本方法時(shí)間和人力成本更低，可幫助實(shí)驗(yàn)進(jìn)行預(yù)篩選。相比傳統(tǒng)計(jì)算方法，本方法提供了更準(zhǔn)確的蛋白質(zhì)單/雙分子穩(wěn)態(tài)構(gòu)型，從而使穩(wěn)定性和結(jié)合能的判斷更準(zhǔn)確，整體提高了激活劑預(yù)測(cè)/驗(yàn)證的正確率，提升效率。