預測/驗證多酚類化合物激活劑對Sirtuin與煙酰胺腺嘌呤結(jié)合效果影響的方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202110006987.8 申請日 -
公開（公告）號 CN112669900A 公開（公告）日 2021-04-16
申請公布號 CN112669900A 申請公布日 2021-04-16
分類號 G16B15/00;G16C20/20 分類 物理
發(fā)明人 黃易寒;李駿;湯小蘇 申請（專利權(quán)）人 杭州諾莘科技有限責任公司
代理機構(gòu) 杭州天勤知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 胡紅娟
地址 311400 浙江省杭州市富陽區(qū)銀湖街道高爾夫路83號第六幢三樓305室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種預測/驗證多酚類化合物激活劑對Sirtuin與煙酰胺腺嘌呤(NAD+)結(jié)合效果影響的方法，利用一系列對復合體系的計算處理和副本交換分子動力學模擬，Sirtuin/NAD+復合物結(jié)構(gòu)和Sirtuin/激活劑/NAD+復合物結(jié)構(gòu)可實現(xiàn)全局優(yōu)化并得到穩(wěn)態(tài)構(gòu)型。在此基礎(chǔ)上對兩種復合物體系進行結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性比較、殘基穩(wěn)定性比較和NAD+與Sirtuin的結(jié)合能比較，預測/驗證激活劑對NAD+與Sirtuin結(jié)合效果的影響。相比實驗方法，本方法時間和人力成本更低，可幫助實驗進行預篩選。相比傳統(tǒng)計算方法，本方法提供了更準確的蛋白質(zhì)單/雙分子穩(wěn)態(tài)構(gòu)型，從而使穩(wěn)定性和結(jié)合能的判斷更準確，整體提高了激活劑預測/驗證的正確率，提升效率。