一種糞便微生物多樣性的自動(dòng)化分析方法
基本信息
| 申請(qǐng)?zhí)?/td> | CN202110008338.1 | 申請(qǐng)日 | - |
| 公開（公告）號(hào) | CN112614540A | 公開（公告）日 | 2021-04-06 |
| 申請(qǐng)公布號(hào) | CN112614540A | 申請(qǐng)公布日 | 2021-04-06 |
| 分類號(hào) | G16B20/00(2019.01)I;G16B45/00(2019.01)I | 分類 | 物理 |
| 發(fā)明人 | 羅奇斌;申玉林;廖勝光;任毅 | 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 | 天津奇云諾德生物醫(yī)學(xué)有限公司 |
| 代理機(jī)構(gòu) | - | 代理人 | - |
| 地址 | 300457天津市濱海新區(qū)洞庭路122號(hào)B區(qū)101 | ||
| 法律狀態(tài) | - | ||
摘要
| 摘要 | 本發(fā)明涉及微生物領(lǐng)域，且公開了一種糞便微生物多樣性的自動(dòng)化分析方法，包括原始下機(jī)數(shù)據(jù)過濾和質(zhì)量控制、宿主基因組比對(duì)、微生物菌群物種注釋和比對(duì)、微生物菌群代謝潛能分析、微生物多樣性分析、結(jié)果統(tǒng)計(jì)和輸出等步驟。所有步驟使用Python腳本連接實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化分析，減少了繁瑣的人工操作，降低了人工操作帶來的各種錯(cuò)誤，方法在計(jì)算了香農(nóng)多樣性指數(shù)和辛普森多樣性指數(shù)的同時(shí)，也分析出了樣本中的不同微生物菌群的豐度和代謝通路等信息，有助于更加全面地了解糞便微生物多樣性，流程在運(yùn)行時(shí)不僅會(huì)輸出各步驟產(chǎn)生的中間結(jié)果，也會(huì)對(duì)相應(yīng)的數(shù)據(jù)做統(tǒng)計(jì)分析及整理，輸出相應(yīng)的圖表，方便使用者的瀏覽，同時(shí)流程運(yùn)行日志記錄所有流程相關(guān)信息，方便在流程運(yùn)行出錯(cuò)時(shí)進(jìn)行篩查。?? |
