一種適用于狐尾藻的Hi-C高通量測(cè)序建庫(kù)方法

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN201910213099.6 申請(qǐng)日 -
公開(kāi)（公告）號(hào) CN109913529A 公開(kāi)（公告）日 2019-06-21
申請(qǐng)公布號(hào) CN109913529A 申請(qǐng)公布日 2019-06-21
分類號(hào) C12Q1/6806（2018.01）I; C40B50/06（2006.01）I 分類 生物化學(xué)；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學(xué)；酶學(xué)；突變或遺傳工程;
發(fā)明人 馮歡 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 嘉興菲沙基因信息有限公司
代理機(jī)構(gòu) 上海精晟知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 馮子玲
地址 314000 浙江省嘉興市嘉善縣大云鎮(zhèn)創(chuàng)業(yè)路555號(hào)C2幢101室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明涉及適用于狐尾藻的Hi?C高通量測(cè)序建庫(kù)方法，包括：1)對(duì)狐尾藻樣品進(jìn)行甲醛交聯(lián)獲得交聯(lián)物料；2)細(xì)胞裂解釋放染色質(zhì)；3)收集染色質(zhì)并依次經(jīng)SDS滅活內(nèi)源酶、MboI核酸內(nèi)切酶酶切打斷獲得酶切后物料；4)末端補(bǔ)平，獲得末端補(bǔ)平后DNA，并對(duì)末端補(bǔ)平DNA進(jìn)行分子內(nèi)連接；5)解交聯(lián)分子內(nèi)連接物料并純化DNA，DNA打斷形成利于測(cè)序的片段；7)構(gòu)建用于高通量測(cè)序的Hi?C文庫(kù)；8)特異性捕獲標(biāo)記了生物素的DNA片段并PCR擴(kuò)增；9)文庫(kù)質(zhì)檢。該方法針對(duì)狐尾藻細(xì)胞的特殊結(jié)構(gòu)，設(shè)計(jì)合適的細(xì)胞破碎方法、甲醛交聯(lián)條件、內(nèi)源酶滅活條件以及合適的工具酶，解決了狐尾藻細(xì)胞壁結(jié)構(gòu)對(duì)Hi?C實(shí)驗(yàn)的影響，實(shí)現(xiàn)了狐尾藻的Hi?C高通量測(cè)序建庫(kù)，擴(kuò)大了Hi?C技術(shù)的適用范圍。