一種適用于海洋藻類的Hi-C高通量測(cè)序建庫(kù)方法
基本信息
| 申請(qǐng)?zhí)?/td> | CN202010274567.3 | 申請(qǐng)日 | - |
| 公開（公告）號(hào) | CN111440844A | 公開（公告）日 | 2020-07-24 |
| 申請(qǐng)公布號(hào) | CN111440844A | 申請(qǐng)公布日 | 2020-07-24 |
| 分類號(hào) | C12Q1/6806(2018.01)I | 分類 | 生物化學(xué)；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學(xué)；酶學(xué)；突變或遺傳工程; |
| 發(fā)明人 | 馮歡 | 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 | 嘉興菲沙基因信息有限公司 |
| 代理機(jī)構(gòu) | 上海精晟知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 | 代理人 | 周瓊 |
| 地址 | 314000浙江省嘉興市嘉善縣大云鎮(zhèn)創(chuàng)業(yè)路555號(hào)C2幢101室 | ||
| 法律狀態(tài) | - | ||
摘要
| 摘要 | 本發(fā)明提供的適用于海洋藻類的Hi?C高通量測(cè)序建庫(kù)方法包括：1)海洋藻類樣品甲醛交聯(lián)；2)液氮研磨和裂解液并行裂解交聯(lián)物料，釋放并收集細(xì)胞染色質(zhì)；3)percoll純化細(xì)胞染色質(zhì)；4)純化后的染色質(zhì)依次經(jīng)SDS滅活內(nèi)源酶、MboI核酸內(nèi)切酶酶切打斷獲得酶切物料；5)酶切物料依次經(jīng)粘性末端補(bǔ)平、分子內(nèi)連接獲得分子內(nèi)連接物料；6)解交聯(lián)分子內(nèi)連接物料并純化，打斷純化后的DNA成利于測(cè)序的片段大小從而獲得DNA測(cè)序文庫(kù)。該方法設(shè)計(jì)合適的細(xì)胞壁去除方法、細(xì)胞核純化方法，使分析階段背景噪音干擾顯著減少，同時(shí)也解決了海洋藻類細(xì)胞壁厚難釋放細(xì)胞質(zhì)、海洋藻類樣品建庫(kù)效果差的技術(shù)問題，實(shí)現(xiàn)了海洋藻類的Hi?C高通量測(cè)序建庫(kù)，擴(kuò)大了Hi?C技術(shù)的適用范圍。?? |
