適用于PacBio測序平臺的原核全長初始轉(zhuǎn)錄本建庫方法及應(yīng)用
基本信息
| 申請?zhí)?/td> | CN202010275291.0 | 申請日 | - |
| 公開（公告）號 | CN111440845A | 公開（公告）日 | 2020-07-24 |
| 申請公布號 | CN111440845A | 申請公布日 | 2020-07-24 |
| 分類號 | C12Q1/6806(2018.01)I | 分類 | 生物化學(xué)；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學(xué)；酶學(xué)；突變或遺傳工程; |
| 發(fā)明人 | 方濤 | 申請（專利權(quán)）人 | 嘉興菲沙基因信息有限公司 |
| 代理機構(gòu) | 上海精晟知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 | 代理人 | 周瓊 |
| 地址 | 314000浙江省嘉興市嘉善縣大云鎮(zhèn)創(chuàng)業(yè)路555號C2幢101室 | ||
| 法律狀態(tài) | - | ||
摘要
| 摘要 | 本發(fā)明提供一種適用于PacBio測序平臺的原核全長初始轉(zhuǎn)錄本建庫方法及應(yīng)用，包括：依次在原核生物總RNA的3’末端加尾、5’末端添加生物素標記帽子，然后捕獲帶有生物素標記的初始轉(zhuǎn)錄本，最后合成初始轉(zhuǎn)錄本全長cDNA并構(gòu)建其PacBio文庫。該方法在原核轉(zhuǎn)錄組的3’末端加尾作為cDNA全長擴增一鏈合成的引物位點，實現(xiàn)了原核生物進行全長轉(zhuǎn)錄組測序，擴大了全長轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)的適用范圍。同時，在初始轉(zhuǎn)錄本5’末端添加生物素標記的帽子，然后富集目標全長初始轉(zhuǎn)錄本，從而去除總RNA中的rRNA，極大的提高了數(shù)據(jù)有效率；合成全長cDNA時，在第一條鏈的末端添加額外核苷酸序列作為第二鏈引物的結(jié)合位點，避免SMARTer技術(shù)的偏好性問題，使測序更加均一。?? |
