固有無序蛋白的藥物分子設(shè)計(jì)方法和裝置

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN202111370449.3 申請(qǐng)日 -
公開（公告）號(hào) CN113990401A 公開（公告）日 2022-01-28
申請(qǐng)公布號(hào) CN113990401A 申請(qǐng)公布日 2022-01-28
分類號(hào) G16C10/00（2019.01）I;G16C20/50（2019.01）I;G16C20/70（2019.01）I 分類 物理
發(fā)明人 孫偉杰 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 北京深勢(shì)科技有限公司
代理機(jī)構(gòu) 北京漢智嘉成知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 姜?jiǎng)?郇春艷
地址 100080北京市海淀區(qū)海淀北二街8號(hào)4層515
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種固有無序蛋白的藥物分子設(shè)計(jì)方法以及裝置。該方法包括如下步驟：根據(jù)固有無序蛋白的氨基酸序列構(gòu)建蛋白初始三維結(jié)構(gòu)，對(duì)蛋白初始三維結(jié)構(gòu)進(jìn)行強(qiáng)化動(dòng)力學(xué)模擬采樣至收斂以獲得蛋白質(zhì)的構(gòu)象系綜，并進(jìn)行熱力學(xué)性質(zhì)分析，以得到熱力學(xué)重要狀態(tài)；根據(jù)強(qiáng)化動(dòng)力學(xué)模擬軌跡聚類后挑選出中心構(gòu)象，然后對(duì)中心構(gòu)象進(jìn)行經(jīng)典分子動(dòng)力學(xué)模擬，根據(jù)模擬軌跡構(gòu)建馬爾科夫態(tài)模型，迭代分子動(dòng)力學(xué)模擬至馬爾科夫態(tài)模型符合標(biāo)準(zhǔn)，然后對(duì)馬爾科夫態(tài)模型進(jìn)行分析，以得到動(dòng)力學(xué)性質(zhì)并且從中獲得動(dòng)力學(xué)重要狀態(tài)；根據(jù)熱力學(xué)重要狀態(tài)和動(dòng)力學(xué)重要狀態(tài)，進(jìn)行深度對(duì)接處理以及分子生成處理，以獲得能夠作用于固有無序蛋白的候選活性藥物分子。