一種虛擬藥物篩選方法、裝置、計(jì)算設(shè)備及存儲介質(zhì)

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201910050902.9 申請日 -
公開(公告)號 CN111462833A 公開(公告)日 2020-07-28
申請公布號 CN111462833A 申請公布日 2020-07-28
分類號 G16C20/30(2019.01)I 分類 物理
發(fā)明人 黃韜;楊晨 申請(專利權(quán))人 深圳智藥信息科技有限公司
代理機(jī)構(gòu) - 代理人 -
地址 518000廣東省深圳市南山區(qū)桃源街道長源社區(qū)學(xué)苑1001號南山智園C2棟17層
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 公開了一種虛擬藥物篩選方法、裝置、計(jì)算設(shè)備、存儲介質(zhì)。所述方法包括:對配體化合物和靶標(biāo)蛋白質(zhì)進(jìn)行分子對接;以對接后的化合物分子所含的每一個原子為參考原子,確定每一參考原子的化合物鄰近原子和蛋白質(zhì)鄰近原子,記錄相應(yīng)的預(yù)定結(jié)構(gòu)信息并映射為結(jié)構(gòu)信息矩陣組;利用神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)對結(jié)構(gòu)信息矩陣組進(jìn)行嵌入操作,由嵌入后的結(jié)構(gòu)信息矩陣組得到化合物?蛋白質(zhì)復(fù)合物的表示矩陣;對所述表示矩陣進(jìn)行卷積、偏置、池化,得到結(jié)構(gòu)向量;將所述結(jié)構(gòu)向量與表示所述化合物的物理化學(xué)性質(zhì)和分子指紋的理化性質(zhì)向量拼接,并經(jīng)神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)加權(quán)和偏置后進(jìn)行全連接操作,得到用于表示所述化合物對所述靶標(biāo)蛋白質(zhì)呈非活性和活性的2維向量,以此進(jìn)行藥物篩選。??