微生物操作分類單元確定和序列輔助分離

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201610333530.7 申請日 -
公開（公告）號 CN106055924A 公開（公告）日 2016-10-26
申請公布號 CN106055924A 申請公布日 2016-10-26
分類號 G06F19/20(2011.01)I;C12Q1/68(2006.01)I;C12Q1/04(2006.01)I 分類 計(jì)算；推算；計(jì)數(shù);
發(fā)明人 趙立平;王景;張夢暉 申請（專利權(quán)）人 上海臻領(lǐng)健康科技有限公司
代理機(jī)構(gòu) 上海麥其知識產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所（普通合伙） 代理人 完美（中國）有限公司;完美（廣東）日用品有限公司;揚(yáng)州完美日用品有限公司
地址 528402 廣東省中山市石岐區(qū)東明北路（民營科技園）
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 基于樣品中微生物的系統(tǒng)發(fā)生信息基因的DNA序列定義樣品中的微生物操作分類單元(OTU)的方法，其通過處理原始序列讀出以獲得合格序列片段，根據(jù)其各自的相對豐度值對其進(jìn)行排序，并且僅使用具有高豐度值的合格序列獲得暫定OTU來進(jìn)行。重新劃歸具有低豐度的合格序列，并且只有當(dāng)所述合格序列與OTU序列具有至少97％的序列相似性時才將所述合格序列分別分配到合適的暫定OTU。本發(fā)明還提供了序列輔助的微生物分離方法。