一種基于Primer3的多重PCR引物設(shè)計(jì)方法

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN201711227679.8 申請(qǐng)日 -
公開（公告）號(hào) CN107937497A 公開（公告）日 2018-04-20
申請(qǐng)公布號(hào) CN107937497A 申請(qǐng)公布日 2018-04-20
分類號(hào) C12Q1/686;C12N15/11 分類 生物化學(xué)；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學(xué)；酶學(xué)；突變或遺傳工程;
發(fā)明人 施玉健;周天亮文;值奇歡;蘭兆吉;鄺建宇 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 拓普基因科技（廣州）有限責(zé)任公司
代理機(jī)構(gòu) 廣州三環(huán)專利商標(biāo)代理有限公司 代理人 拓普基因科技（廣州）有限責(zé)任公司
地址 510000 廣東省廣州市天河區(qū)天河北路626號(hào)804房
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供了一種基于Primer3的多重PCR引物設(shè)計(jì)方法，其包括：S1：獲取目標(biāo)DNA序列的原始序列；S2：Primer3對(duì)目標(biāo)序列進(jìn)行PCR引物設(shè)計(jì)，并生成候選引物；S3：用PE模型或SE模型對(duì)多重PCR引物進(jìn)行評(píng)估，并篩選出合格的多重PCR引物；S4：改變引物篩選參數(shù)，再次對(duì)未能設(shè)計(jì)出引物的目標(biāo)DNA序列進(jìn)行設(shè)計(jì)和篩選，最終獲得所有目標(biāo)DNA序列的多重PCR引物。本發(fā)明可識(shí)別序列相距較近的目標(biāo)序列并設(shè)計(jì)兼并引物，進(jìn)而減少因相距較近的目標(biāo)序列的引物相互干擾而導(dǎo)致的非特異性擴(kuò)增；系統(tǒng)性評(píng)估所設(shè)計(jì)引物的特異性，減少因非特異性擴(kuò)增、出現(xiàn)引物二聚體和發(fā)夾結(jié)構(gòu)等原因?qū)е碌臄U(kuò)增失敗，為多重PCR實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)出特異性較強(qiáng)的多重PCR引物。