比對不同全基因組測序方法的測序結(jié)果覆蓋率的方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202110673259.2 申請日 -
公開（公告）號 CN113223619A 公開（公告）日 2021-08-06
申請公布號 CN113223619A 申請公布日 2021-08-06
分類號 G16B30/10;G16B50/30 分類 物理
發(fā)明人 易康;安泰然 申請（專利權(quán)）人 南京諾因生物科技有限公司
代理機構(gòu) 南京禾易知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 張松云
地址 211800 江蘇省南京市江北新區(qū)新錦湖路3-1號中丹生態(tài)生命科學(xué)產(chǎn)業(yè)園一期A座1802-1807
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種比對不同全基因組測序方法的測序結(jié)果覆蓋率的方法，其步驟包括：讀取同一物種不同全基因組的測序結(jié)果，創(chuàng)建一個新的fasta文件夾，將fasta文件復(fù)制到fasta文件夾中；對fasta文件夾下的fasta文件進行建庫；將fasta文件夾下fasta文件序列進行分割；使用blast工具將分割后的片段與第二步建好的數(shù)據(jù)庫進行比對；通過篩選將比對到自身的序列去除；對過濾后的結(jié)果進行得分計算，排分最高的就是覆蓋率最高的全基因組測序方法得到的測序結(jié)果。本發(fā)明通過對比結(jié)果，可以輕松找出哪個基因組覆蓋率更高。