基于特征序列設(shè)計(jì)引物的方法及系統(tǒng)

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202110754999.9 申請日 -
公開（公告）號 CN113403368A 公開（公告）日 2021-09-17
申請公布號 CN113403368A 申請公布日 2021-09-17
分類號 C12Q1/6811（2018.01）I 分類 生物化學(xué)；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學(xué)；酶學(xué)；突變或遺傳工程;
發(fā)明人 易康;安泰然 申請（專利權(quán)）人 南京諾因生物科技有限公司
代理機(jī)構(gòu) 南京禾易知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 張松云
地址 211800江蘇省南京市江北新區(qū)新錦湖路3-1號中丹生態(tài)生命科學(xué)產(chǎn)業(yè)園一期A座1802-1807
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種基于特征序列設(shè)計(jì)引物的方法，其步驟包括：將陽性序列和陰性序列進(jìn)行整合；將陽性序列分割成適合進(jìn)行比對的片段，并記錄分割的位置；使用blast對陰性序列進(jìn)行建庫，然后將片段化的陽性序列比對到陰性序列進(jìn)行篩選，得到一致性較低的特異性序列；使用primer3對特異性序列進(jìn)行引物設(shè)計(jì)，得到上游引物、下游引物和探針的序列及位置；使用blast比對軟件、陰性序列數(shù)據(jù)庫、NCBI的nt數(shù)據(jù)庫對得到的引物和探針進(jìn)行再次篩選，并取引物和探針的交集；通過目錄輸出比對結(jié)果。并公開了基于特征序列設(shè)計(jì)引物的系統(tǒng)。本發(fā)明可以一步完成從基因組到目標(biāo)序列和引物片段的引物設(shè)計(jì)。