確定待測(cè)樣本預(yù)定染色體不穩(wěn)定指數(shù)的方法、系統(tǒng)和計(jì)算機(jī)可讀介質(zhì)
基本信息
申請(qǐng)?zhí)?/td> | CN201910428251.2 | 申請(qǐng)日 | - |
公開(kāi)(公告)號(hào) | CN111370056B | 公開(kāi)(公告)日 | 2021-03-30 |
申請(qǐng)公布號(hào) | CN111370056B | 申請(qǐng)公布日 | 2021-03-30 |
分類(lèi)號(hào) | G16B30/10(2019.01)I;G16B35/10(2019.01)I;G16B20/20(2019.01)I | 分類(lèi) | 物理 |
發(fā)明人 | 李世勇;茅矛;張鋒;陳彥;鐘果林;張巖;陳灝;封裕敏 | 申請(qǐng)(專(zhuān)利權(quán))人 | 深圳思勤醫(yī)療科技有限公司 |
代理機(jī)構(gòu) | 北京清亦華知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所(普通合伙) | 代理人 | 趙天月 |
地址 | 518000廣東省深圳市鹽田區(qū)海山街道深鹽路2028號(hào)大百匯生命健康產(chǎn)業(yè)園2號(hào)樓11層 | ||
法律狀態(tài) | - |
摘要
摘要 | 本發(fā)明提出了確定待測(cè)樣本預(yù)定染色體不穩(wěn)定指數(shù)的方法。該方法包括:(1)劃分窗口序列(bins);(2)與所述參考序列;(3)統(tǒng)計(jì)bins中每一個(gè)的匹配測(cè)序讀段數(shù)目;(4)對(duì)每個(gè)bins的匹配測(cè)序讀段數(shù)目進(jìn)行過(guò)濾,標(biāo)準(zhǔn)化,校正處理;(5)對(duì)步驟(4)所獲得的結(jié)果進(jìn)行取對(duì)數(shù)處理,以便獲得每個(gè)bins的測(cè)序讀段數(shù)目的對(duì)數(shù)值log R ratio;(6)確定第一預(yù)選異常窗口序列;(7)確定第二預(yù)選異常窗口序列;(8)確定異常窗口序列;(9)確定所述異常窗口序列的每一個(gè)拷貝數(shù)變異發(fā)生頻率;(10)確定所述待測(cè)樣本針對(duì)所述預(yù)定染色體的不穩(wěn)定指數(shù)。?? |
