一種基于顯微圖像的類器官細胞計數(shù)方法及系統(tǒng)

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202110601326.X 申請日 -
公開（公告）號 CN113283353B 公開（公告）日 2022-04-01
申請公布號 CN113283353B 申請公布日 2022-04-01
分類號 G06V20/69;G06V10/764;G06K9/62;G06N20/00 分類 計算；推算；計數(shù);
發(fā)明人 李剛;陳澤新;張珉翔;黃敏 申請（專利權）人 創(chuàng)芯國際生物科技（廣州）有限公司
代理機構 廣州容大知識產(chǎn)權代理事務所（普通合伙） 代理人 劉新年
地址 510600 廣東省廣州市黃埔區(qū)開源大道11號C3棟601室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供一種基于顯微圖像的類器官細胞計數(shù)方法及系統(tǒng)。該方法包括：采用光學顯微鏡將每個待計數(shù)類器官的孔板劃分成多個視野區(qū)域進行掃描拍照；將同一孔板的所有類器官圖像拼接成一張全景圖；確定所有全景圖中符合要求的類器官，然后計算每個類器官的寬度、高度、平均灰度信息，通過獲得的每個類器官的寬度、高度、平均灰度和質(zhì)量評估結果這四個參數(shù)構建四元組；將人工計算值和類器官屬性信息輸入深度學習模型進行迭代訓練，構建兩層全連接網(wǎng)絡M，構建網(wǎng)絡的損失函數(shù)δ，將獲得的損失函數(shù)和迭代訓練獲得的細胞數(shù)預測模型送入GPU中再次進行迭代訓練，直至損失函數(shù)δ小于給定閾值停止訓練；利用訓練好的深度學習模型對類器官進行自動細胞計數(shù)。