一種基于顯微圖像的類器官細(xì)胞計數(shù)方法及系統(tǒng)

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202110601326.X 申請日 -
公開（公告）號 CN113283353A 公開（公告）日 2021-08-20
申請公布號 CN113283353A 申請公布日 2021-08-20
分類號 G06K9/00（2006.01）I;G06K9/62（2006.01）I;G06N20/00（2019.01）I 分類 計算；推算；計數(shù);
發(fā)明人 李剛;陳澤新;張珉翔;黃敏 申請（專利權(quán)）人 創(chuàng)芯國際生物科技（廣州）有限公司
代理機(jī)構(gòu) 廣州容大知識產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所（普通合伙） 代理人 劉新年
地址 510600廣東省廣州市黃埔區(qū)開源大道11號C3棟601室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供一種基于顯微圖像的類器官細(xì)胞計數(shù)方法及系統(tǒng)。該方法包括：采用光學(xué)顯微鏡將每個待計數(shù)類器官的孔板劃分成多個視野區(qū)域進(jìn)行掃描拍照；將同一孔板的所有類器官圖像拼接成一張全景圖；確定所有全景圖中符合要求的類器官，然后計算每個類器官的寬度、高度、平均灰度信息，通過獲得的每個類器官的寬度、高度、平均灰度和質(zhì)量評估結(jié)果這四個參數(shù)構(gòu)建四元組；將人工計算值和類器官屬性信息輸入深度學(xué)習(xí)模型進(jìn)行迭代訓(xùn)練，構(gòu)建兩層全連接網(wǎng)絡(luò)M，構(gòu)建網(wǎng)絡(luò)的損失函數(shù)δ，將獲得的損失函數(shù)和迭代訓(xùn)練獲得的細(xì)胞數(shù)預(yù)測模型送入GPU中再次進(jìn)行迭代訓(xùn)練，直至損失函數(shù)δ小于給定閾值停止訓(xùn)練；利用訓(xùn)練好的深度學(xué)習(xí)模型對類器官進(jìn)行自動細(xì)胞計數(shù)。