用于檢測基因融合的靶向測序方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202010895988.8 申請日 -
公開（公告）號 CN111979307A 公開（公告）日 2020-11-24
申請公布號 CN111979307A 申請公布日 2020-11-24
分類號 C12Q1/6869 分類 生物化學(xué)；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學(xué)；酶學(xué)；突變或遺傳工程;
發(fā)明人 陳文浩;韓營民;盧亞明 申請（專利權(quán)）人 伯科生物科技有限公司
代理機構(gòu) 北京北匯律師事務(wù)所 代理人 高元吉
地址 214000 江蘇省無錫市錫山區(qū)安鎮(zhèn)街道丹山路78號錫東創(chuàng)融大廈D座5層
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明一種用于檢測基因融合的靶向測序方法，其包括提取樣本的總RNA，反轉(zhuǎn)錄得到cDNA，然后片段化為150?250pb的片段、并在末端修復(fù)、加A，連接測序接頭，得到預(yù)文庫；利用封閉阻斷劑封閉預(yù)文庫，然后使特定的探針組與預(yù)文庫雜交，獲得捕獲片段，經(jīng)PCR富集和純化后質(zhì)檢，得到測序文庫；利用二代測序?qū)y序文庫進行測序，獲得基因融合信息。本發(fā)明的方法在使用更少的探針和更低的測序數(shù)據(jù)量時，仍然能夠保持高的捕獲效率，獲得比傳統(tǒng)捕獲更多的陽性Reads，減少了探針合成和測序成本，提高了檢測靈敏度。