基于句法模式識別的藥物小分子毒性預(yù)測的方法
基本信息
| 申請?zhí)?/td> | CN202010460271.0 | 申請日 | - |
| 公開（公告）號 | CN111640470A | 公開（公告）日 | 2020-09-08 |
| 申請公布號 | CN111640470A | 申請公布日 | 2020-09-08 |
| 分類號 | G16C20/30(2019.01)I | 分類 | 物理 |
| 發(fā)明人 | 牛張明;韋德·門佩斯-史密斯 | 申請（專利權(quán)）人 | 杭州德睿智藥科技有限公司 |
| 代理機構(gòu) | 上海智晟知識產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所（特殊普通合伙） | 代理人 | 牛張明;韋德·門佩斯-史密斯 |
| 地址 | 浙江省杭州市錢塘新區(qū)新加坡科技園15幢11樓 | ||
| 法律狀態(tài) | - | ||
摘要
| 摘要 | 本發(fā)明公開了一種基于句法模式識別的藥物小分子毒性預(yù)測的方法，包括：獲取數(shù)據(jù)集；對所述數(shù)據(jù)集進行預(yù)處理，包括將所述數(shù)據(jù)集中的所有化合物分子用SMILES表示，對所有分子的SMILES表達式做標準化處理，統(tǒng)一分子SMILES表達式中的原子、鍵、連接關(guān)系的編碼方式和順序，然后進行去重復(fù)化處理；對預(yù)處理的數(shù)據(jù)集進行編碼，其中通過獨熱編碼對SMILES序列的單個元素、單個數(shù)字、單個符號以及整個方括號看作一個基元片段。每個基元片段本身是具有化學(xué)意義和指向性的，任何基元片段的組合也是符合化學(xué)規(guī)則，所述所有分子的SMILES表達式轉(zhuǎn)換為向量組合；構(gòu)建句法模式識別模型；將向量組合輸入所述句法模式識別模型，預(yù)估分子是否含有特定靶標的毒性；以及對所述句法模式識別模型進行評估。?? |
