一種基于二代測序的人類白細(xì)胞抗原分型系統(tǒng)和方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN202110797301.1 申請日 -
公開（公告）號 CN113373208A 公開（公告）日 2021-09-10
申請公布號 CN113373208A 申請公布日 2021-09-10
分類號 C12Q1/6869（2018.01）I;G16B20/30（2019.01）I;G16B30/10（2019.01）I 分類 生物化學(xué)；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學(xué)；酶學(xué)；突變或遺傳工程;
發(fā)明人 李傲;蔡麗婷;王佳偉 申請（專利權(quán)）人 上海序禎達(dá)生物科技有限公司
代理機(jī)構(gòu) 上海市匯業(yè)律師事務(wù)所 代理人 王函;余艷
地址 200131上海市浦東新區(qū)中國（上海）自由貿(mào)易試驗(yàn)區(qū)奧納路55號1幢607室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種基于二代測序的人類白細(xì)胞抗原分型系統(tǒng)和方法。該系統(tǒng)，包括：二代測序模塊，用于DNA樣本的二代測序；高精度HLA比對模塊，用于通過高精度高穩(wěn)定性的比對方法將二代測序數(shù)據(jù)比對至HLA參考序列上；HLA分型模塊，用于利用距離矩陣方法對比對至HLA參考序列上的數(shù)據(jù)進(jìn)行HLA分型；高精度HLA比對模塊分別與二代測序模塊和HLA分型模塊信號連接。本發(fā)明解決了HLA分型準(zhǔn)確度和穩(wěn)定性低的問題。通過優(yōu)選高精度高穩(wěn)定性的方法，本發(fā)明能夠在保持準(zhǔn)確度的前提下，大幅提升HLA分型的穩(wěn)定性，從而提升下游免疫治療療法的有效性與安全性。