基因高通量測(cè)序數(shù)據(jù)突變檢測(cè)方法
基本信息
申請(qǐng)?zhí)?/td> | CN201711214506.2 | 申請(qǐng)日 | - |
公開(公告)號(hào) | CN107944225A | 公開(公告)日 | 2018-04-20 |
申請(qǐng)公布號(hào) | CN107944225A | 申請(qǐng)公布日 | 2018-04-20 |
分類號(hào) | G06F19/20 | 分類 | 計(jì)算;推算;計(jì)數(shù); |
發(fā)明人 | 李超 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人 | 慧算醫(yī)療科技(上海)有限公司 |
代理機(jī)構(gòu) | 上海伯瑞杰知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 | 代理人 | 慧算醫(yī)療科技(上海)有限公司 |
地址 | 201209 上海市浦東新區(qū)自由貿(mào)易試驗(yàn)區(qū)芳春路400號(hào)1幢3層 | ||
法律狀態(tài) | - |
摘要
摘要 | 本發(fā)明提供一種基因高通量測(cè)序數(shù)據(jù)突變檢測(cè)方法,包括步驟:S1:獲取一基因樣本的高通量測(cè)序數(shù)據(jù);S2:生成所述基因樣本的高通量測(cè)序數(shù)據(jù)的各基因序列的位置信息標(biāo)簽;S3:根據(jù)所述位置信息標(biāo)簽將各所述基因序列分組并計(jì)算獲得一突變總量;S4:將所述突變總量代入一背景模型輸出突變檢測(cè)結(jié)果。本發(fā)明的一種基因高通量測(cè)序數(shù)據(jù)突變檢測(cè)方法,采用虛擬分子標(biāo)簽與背景數(shù)據(jù)庫結(jié)合的方法降低噪音,提高檢測(cè)的特異性和敏感性,可在不增加實(shí)驗(yàn)成本的前提下能有效的降低實(shí)驗(yàn)中的隨機(jī)誤差,結(jié)合背景數(shù)據(jù)庫對(duì)系統(tǒng)誤差的校正,可以達(dá)到準(zhǔn)確鑒定低豐度突變的目的。 |
