預(yù)測小分子CYP代謝酶的代謝位點(diǎn)的方法及系統(tǒng)

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN202110420115.6 申請(qǐng)日 -
公開(公告)號(hào) CN113270152A 公開(公告)日 2021-08-17
申請(qǐng)公布號(hào) CN113270152A 申請(qǐng)公布日 2021-08-17
分類號(hào) G16C20/50(2019.01)I;G16C20/30(2019.01)I;G06N3/04(2006.01)I;G06N3/08(2006.01)I 分類 物理
發(fā)明人 李遠(yuǎn)鵬;陳萍;賴力鵬;溫書豪;馬健 申請(qǐng)(專利權(quán))人 北京晶泰科技有限公司
代理機(jī)構(gòu) 深圳市科吉華烽知識(shí)產(chǎn)權(quán)事務(wù)所(普通合伙) 代理人 胡玉
地址 100083北京市海淀區(qū)中關(guān)村東路8號(hào)東升大廈AB座七層706單元
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 一種預(yù)測小分子CYP代謝酶的代謝位點(diǎn)的方法及系統(tǒng),包括:收集與代謝位點(diǎn)相關(guān)的分子結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù),基于不同代謝酶亞型將收集的數(shù)據(jù)整理成為不同亞型的數(shù)據(jù)集;將二維分子結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)化為三維分子結(jié)構(gòu);將分子三維結(jié)構(gòu)中的原子類型的矢量化;將分子三維結(jié)構(gòu)中距離的矢量化;將原子類型的矢量作為圖卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)中頂點(diǎn)信息矢量化矩陣,將距離的矢量作為圖卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)中邊信息矢量化矩陣,根據(jù)圖卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型更新頂點(diǎn)信息,計(jì)算原子為代謝位點(diǎn)的概率;在不同CYP代謝酶亞型上根據(jù)為代謝位點(diǎn)的概率預(yù)測代謝位點(diǎn);上述方法及系統(tǒng),對(duì)分子與不同亞型的CYP代謝發(fā)生化學(xué)反應(yīng)的代謝位點(diǎn)預(yù)測,該預(yù)測結(jié)果可以幫助藥物化學(xué)家設(shè)計(jì)或者優(yōu)化分子結(jié)構(gòu)。