一種基于TopoMA定量構(gòu)效關(guān)系模型的藥物設(shè)計(jì)方法
基本信息
| 申請(qǐng)?zhí)?/td> | CN202011085973.1 | 申請(qǐng)日 | - |
| 公開(kāi)（公告）號(hào) | CN112102900A | 公開(kāi)（公告）日 | 2020-12-18 |
| 申請(qǐng)公布號(hào) | CN112102900A | 申請(qǐng)公布日 | 2020-12-18 |
| 分類(lèi)號(hào) | G16C20/50;G16C20/70;G16C20/90;G16C20/80 | 分類(lèi) | 物理 |
| 發(fā)明人 | 馬松齡;馬文志;賴(lài)力鵬;溫書(shū)豪;馬健 | 申請(qǐng)（專(zhuān)利權(quán)）人 | 北京晶泰科技有限公司 |
| 代理機(jī)構(gòu) | 深圳市科吉華烽知識(shí)產(chǎn)權(quán)事務(wù)所（普通合伙） | 代理人 | 北京晶派科技有限公司 |
| 地址 | 100083 北京市海淀區(qū)中關(guān)村東路8號(hào)東升大廈C座三層333單元 | ||
| 法律狀態(tài) | - | ||
摘要
| 摘要 | 本發(fā)明提供一種基于TopoMA定量構(gòu)效關(guān)系模型的藥物設(shè)計(jì)方法，包括：步驟（1）:在一個(gè)化合物上指定若干非環(huán)單鍵，通過(guò)所述非環(huán)單鍵將化合物分割出多個(gè)側(cè)鏈；步驟（2）：對(duì)于步驟（1）中分割出的每條側(cè)鏈，TopoMA會(huì)執(zhí)行側(cè)鏈對(duì)齊至定位基、手性檢查與調(diào)整、單鍵二面角調(diào)整以及非平面環(huán)檢查與調(diào)整；步驟（3）：對(duì)側(cè)鏈進(jìn)行CoMFA分析，通過(guò)SP3碳原子探針計(jì)算側(cè)鏈在三維空間中的立體場(chǎng)描述符與靜電場(chǎng)描述符，將每個(gè)分子三維格點(diǎn)的描述符平鋪為一維向量，由多個(gè)分子的描述符組成矩陣，每個(gè)分子產(chǎn)生一個(gè)特征向量；步驟（4）：建立分子描述符與生物活性數(shù)據(jù)之間關(guān)系的模型。相對(duì)于Topomer CoMFA方法采用PLS建模的單一建模方法而言，本發(fā)明有更大可能得到更好的模型。 |
