一種蛋白骨架設(shè)計方法及其應(yīng)用
基本信息
| 申請?zhí)?/td> | CN202011382858.0 | 申請日 | - |
| 公開（公告）號 | CN112382336A | 公開（公告）日 | 2021-02-19 |
| 申請公布號 | CN112382336A | 申請公布日 | 2021-02-19 |
| 分類號 | G16B5/00(2019.01)I; | 分類 | 物理 |
| 發(fā)明人 | 王天元;吳煒坤;賴力鵬;溫書豪;馬健 | 申請（專利權(quán)）人 | 北京晶泰科技有限公司 |
| 代理機構(gòu) | 深圳市科吉華烽知識產(chǎn)權(quán)事務(wù)所（普通合伙） | 代理人 | 胡吉科 |
| 地址 | 100083北京市海淀區(qū)中關(guān)村東路8號東升大廈C座三層333單元 | ||
| 法律狀態(tài) | - | ||
摘要
| 摘要 | 本發(fā)明提供一種小蛋白骨架的設(shè)計方法及其應(yīng)用，包括以下步驟，S1：創(chuàng)建專用的結(jié)構(gòu)片段數(shù)據(jù)庫；S2:生成小蛋白骨架數(shù)據(jù)庫；S3:對小蛋白骨架進行氨基酸序列優(yōu)化和設(shè)計；S4:采用與穩(wěn)定性相關(guān)的指標對結(jié)構(gòu)進行評價和過濾，不滿足標準的結(jié)構(gòu)將被移除過濾，最終形成計算預測上能夠穩(wěn)定折疊的小蛋白。本方法與現(xiàn)有方法最大的不同在于，文獻報道設(shè)計的拓撲結(jié)構(gòu)為HLHLHLHLH，而本發(fā)明設(shè)計的是更小的拓撲結(jié)構(gòu)為HLHLH的蛋白，并且本發(fā)明根據(jù)HLHLH 拓撲結(jié)構(gòu)的專門定義了更加嚴格的過濾標準，改進了SEWING的采樣方法，因此設(shè)計出來的蛋白穩(wěn)定性和序列可設(shè)計性應(yīng)當更高，并且計算過程中優(yōu)質(zhì)骨架生成的效率更高。?? |
