一種基于高通量測序的線粒體序列拼接及拷貝數(shù)測定的方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201710265077.5 申請日 -
公開（公告）號 CN108733974A 公開（公告）日 2018-11-02
申請公布號 CN108733974A 申請公布日 2018-11-02
分類號 G06F19/18 分類 計算；推算；計數(shù);
發(fā)明人 王堯峰;薛金會;郭海燕;王偉偉;程恩澤 申請（專利權(quán)）人 沈陽中科賽爾生物科技有限公司
代理機構(gòu) 沈陽科苑專利商標代理有限公司 代理人 李穎;周秀梅
地址 110169 遼寧省沈陽市渾南區(qū)創(chuàng)新路153-6號
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明屬于基因組學技術(shù)領(lǐng)域，具體涉及一種利用高通量測序(下一代測序、第二代測序、深度測序)技術(shù)直接測定真核生物線粒體序列及拷貝數(shù)的方法。本發(fā)明包括對總DNA進行高通量測序；測序數(shù)據(jù)的質(zhì)控；基于類似宏基因組的序列拼接；線粒體含量的計算。本方法實現(xiàn)了在不需進行線粒體富集操作的前提下使用較少測序數(shù)據(jù)進行線粒體的組裝，具有實驗簡單，樣本質(zhì)量要求低，拼接完整度好，可以測量線粒體相對含量的特點?？梢栽谝欢ǔ潭壬蠞M足科研及應(yīng)用需求。