一種FFPE組織樣本的超低頻建庫方法

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201711355441.3 申請日 -
公開（公告）號 CN107916288A 公開（公告）日 2018-04-17
申請公布號 CN107916288A 申請公布日 2018-04-17
分類號 C12Q1/6806;C12N15/10;C40B50/06 分類 生物化學(xué)；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物學(xué)；酶學(xué)；突變或遺傳工程;
發(fā)明人 張仕堅;嚴(yán)建龍 申請（專利權(quán)）人 普瑞基準(zhǔn)生物醫(yī)藥（蘇州）有限公司
代理機構(gòu) 北京華識知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 普瑞基準(zhǔn)科技（北京）有限公司
地址 100000 北京市海淀區(qū)清河三街72號23號樓2層2166室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種FFPE組織樣本的超低頻建庫方法，步驟包括：FFPE樣本的DNA提?。籇NA打斷；去磷酸化與DNA變性；生物素UID單鏈接頭的添加；鏈霉素磁珠捕獲與洗脫；雙鏈第二接頭的添加與文庫洗脫：通過T4DNA連接酶，在上述靶DNA分子的另一端加上第二個接頭，并洗去過剩與殘留的接頭；LM?PCR擴增，引入barcode；磁珠純化PCR擴增產(chǎn)物。本發(fā)明針對某些嚴(yán)重降解的FFPE DNA微量樣本實現(xiàn)建庫捕獲測序，在建庫開始前通過引入UID標(biāo)簽接頭，從而為后續(xù)排除建庫、捕獲以及上機測序過程中引入的技術(shù)突變提供前提條件。