一種基于發(fā)卡結(jié)構(gòu)的目標(biāo)區(qū)域捕獲方法及其應(yīng)用

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN201610877566.1 申請(qǐng)日 -
公開(公告)號(hào) CN106399519B 公開(公告)日 2019-07-26
申請(qǐng)公布號(hào) CN106399519B 申請(qǐng)公布日 2019-07-26
分類號(hào) C12Q1/6806(2018.01)I 分類 生物化學(xué);啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物學(xué);酶學(xué);突變或遺傳工程;
發(fā)明人 鄭衛(wèi)國(guó); 盧文翔; 涂慧珍; 熊麗娟; 朱淼; 白云飛; 朱毅華; 顧萬君 申請(qǐng)(專利權(quán))人 南京迪康金諾生物技術(shù)有限公司
代理機(jī)構(gòu) 南京經(jīng)緯專利商標(biāo)代理有限公司 代理人 南京迪康金諾生物技術(shù)有限公司; 無錫中德美聯(lián)生物技術(shù)有限公司
地址 210019 江蘇省南京市建鄴區(qū)嘉陵江東街18號(hào)03棟402室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開了一種基于發(fā)卡結(jié)構(gòu)的目標(biāo)區(qū)域捕獲方法及其應(yīng)用,包括上下游引物設(shè)計(jì),發(fā)卡結(jié)構(gòu)形成,上游引物擴(kuò)增產(chǎn)物消化、純化,及下游引物富集擴(kuò)增過程。本發(fā)明僅有上游引物3’端擴(kuò)增的產(chǎn)物能與上游引物5’端形成發(fā)卡結(jié)構(gòu)的區(qū)域被捕獲,因而特異性強(qiáng);形成的發(fā)卡結(jié)構(gòu)序列特殊,使得下游引物組可以對(duì)目標(biāo)捕獲區(qū)域進(jìn)行指數(shù)擴(kuò)增,因而極少量基因組即可達(dá)到后續(xù)檢測(cè)需要,靈敏度高;用于本方法的引物組可以通過DNA芯片技術(shù)合成引物池,因而可以同時(shí)檢測(cè)數(shù)千個(gè)目標(biāo)區(qū)域,實(shí)現(xiàn)高、低通量的兼容;本發(fā)明的方法設(shè)計(jì)簡(jiǎn)單,僅需設(shè)計(jì)目標(biāo)捕獲區(qū)域的上下游引物,避免固相或液相捕獲方法的設(shè)計(jì)大量全區(qū)域捕獲探針的麻煩;檢測(cè)成本低。