一種獲得基因單體型序列的方法及其應(yīng)用

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN201810992800.4 申請(qǐng)日 -
公開(kāi)(公告)號(hào) CN108985009B 公開(kāi)(公告)日 2022-06-07
申請(qǐng)公布號(hào) CN108985009B 申請(qǐng)公布日 2022-06-07
分類(lèi)號(hào) G16B30/10(2019.01)I 分類(lèi) 計(jì)算;推算;計(jì)數(shù);
發(fā)明人 郎娜;梁帆;楊旗;查建軍;高玉梅;賀希文;汪德鵬 申請(qǐng)(專(zhuān)利權(quán))人 北京希望組生物科技有限公司
代理機(jī)構(gòu) 北京紀(jì)凱知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 -
地址 102206北京市昌平區(qū)科技園區(qū)生命園路29號(hào)1幢A301-303室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明的一方面提供了一種獲得基因單體型序列的方法,所述方法包括步驟:1)生成矩陣;2)分相,包括步驟:2.1)按窗口編碼歸一化矩陣;2.2)篩選雜合分相窗口;3)相位的確定;4)精細(xì)分相;5)矯正;6)基因分型。本發(fā)明的另一方面提供上述方法在基因分型中的應(yīng)用。本發(fā)明的方法適合多態(tài)性高、重復(fù)序列復(fù)雜的序列,使用滑窗矯正分相,去除了比對(duì)多樣性和錯(cuò)誤率的影響,并使用循環(huán)迭代分相,達(dá)到一致性最高的分相結(jié)果。