一種獲得基因單體型序列的方法及其應用

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201810992800.4 申請日 -
公開(公告)號 CN108985009B 公開(公告)日 2022-06-07
申請公布號 CN108985009B 申請公布日 2022-06-07
分類號 G16B30/10(2019.01)I 分類 計算;推算;計數(shù);
發(fā)明人 郎娜;梁帆;楊旗;查建軍;高玉梅;賀希文;汪德鵬 申請(專利權)人 北京希望組生物科技有限公司
代理機構 北京紀凱知識產(chǎn)權代理有限公司 代理人 -
地址 102206北京市昌平區(qū)科技園區(qū)生命園路29號1幢A301-303室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明的一方面提供了一種獲得基因單體型序列的方法,所述方法包括步驟:1)生成矩陣;2)分相,包括步驟:2.1)按窗口編碼歸一化矩陣;2.2)篩選雜合分相窗口;3)相位的確定;4)精細分相;5)矯正;6)基因分型。本發(fā)明的另一方面提供上述方法在基因分型中的應用。本發(fā)明的方法適合多態(tài)性高、重復序列復雜的序列,使用滑窗矯正分相,去除了比對多樣性和錯誤率的影響,并使用循環(huán)迭代分相,達到一致性最高的分相結果。