同源序列和同源序列中串聯(lián)重復(fù)序列的檢測方法、計算機(jī)可讀介質(zhì)和應(yīng)用

基本信息

申請?zhí)?/td> CN201910599481.5 申請日 -
公開（公告）號 CN111508561A 公開（公告）日 2020-08-07
申請公布號 CN111508561A 申請公布日 2020-08-07
分類號 G16B30/10 分類 -
發(fā)明人 靳紅帥;吳昕;汪德鵬 申請（專利權(quán)）人 北京希望組生物科技有限公司
代理機(jī)構(gòu) 北京超成律師事務(wù)所 代理人 高榮英
地址 102200 北京市昌平區(qū)科技園區(qū)生命園路29號1幢A301-3室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明提供了一種同源序列和同源序列中串聯(lián)重復(fù)序列的檢測方法、計算機(jī)可讀介質(zhì)和應(yīng)用，涉及基因測序技術(shù)領(lǐng)域。同源序列的檢測方法包括提取出目標(biāo)同源序列間的差異位點(diǎn)作為打分位點(diǎn)給測序reads打分，并通過合理的計算分值的方法，將測序reads匹配至與其同源性最高的同源序列中，提高了數(shù)據(jù)分析的準(zhǔn)確性。同源序列中串聯(lián)重復(fù)序列的檢測方法采用將測序reads和重復(fù)單元標(biāo)準(zhǔn)序列比對以獲得該條reads的重復(fù)序列的重復(fù)數(shù)，通過統(tǒng)計與目標(biāo)同源序列reads的重復(fù)序列的重復(fù)數(shù)的支持reads數(shù)獲取同源序列中重復(fù)序列的重復(fù)數(shù)，緩解了現(xiàn)有技術(shù)中缺乏一種兼具效率和準(zhǔn)確度的檢測重復(fù)序列的檢測方法的問題。