一種基于Bionano平臺(tái)檢測長串聯(lián)重復(fù)序列的方法
基本信息
| 申請?zhí)?/td> | CN201810191588.1 | 申請日 | - |
| 公開（公告）號(hào) | CN108460248B | 公開（公告）日 | 2022-02-22 |
| 申請公布號(hào) | CN108460248B | 申請公布日 | 2022-02-22 |
| 分類號(hào) | G16B40/00（2019.01）I;G16B20/30（2019.01）I | 分類 | 計(jì)算；推算；計(jì)數(shù); |
| 發(fā)明人 | 李丕棟;周家蓬;王凱;孫貝貝;汪德鵬 | 申請（專利權(quán)）人 | 北京希望組生物科技有限公司 |
| 代理機(jī)構(gòu) | 北京紀(jì)凱知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 | 代理人 | 陸惠中;王永偉 |
| 地址 | 102206北京市昌平區(qū)科技園區(qū)生命園路29號(hào)1幢A301-3室 | ||
| 法律狀態(tài) | - | ||
摘要
| 摘要 | 本發(fā)明提供一種基于Bionano平臺(tái)檢測長串聯(lián)重復(fù)序列的方法。本發(fā)明的方法通過構(gòu)建樸素貝葉斯分類器機(jī)器學(xué)習(xí)模型，對Bionano數(shù)據(jù)進(jìn)行過濾，去除插入、缺失位點(diǎn)的假陽性錯(cuò)誤，并基于比對算法實(shí)現(xiàn)長串聯(lián)重復(fù)單元計(jì)數(shù)，減少運(yùn)行時(shí)間、計(jì)算資源的消耗。所述方法還可以結(jié)合聚類分析算法和每條reads上的重復(fù)單元數(shù)目，確定樣本基因型為純合、雜合或者嵌合體。 |
