一種基于三代測(cè)序平臺(tái)的HLA基因分型方法

基本信息

申請(qǐng)?zhí)?/td> CN201810191663.4 申請(qǐng)日 -
公開(kāi)（公告）號(hào) CN108460246B 公開(kāi)（公告）日 2022-02-22
申請(qǐng)公布號(hào) CN108460246B 申請(qǐng)公布日 2022-02-22
分類號(hào) G16B30/10（2019.01）I;C12Q1/6869（2018.01）I 分類 計(jì)算；推算；計(jì)數(shù);
發(fā)明人 郎娜;金杰;龔淳;楊帆;周家蓬;汪德鵬 申請(qǐng)（專利權(quán)）人 北京希望組生物科技有限公司
代理機(jī)構(gòu) 北京紀(jì)凱知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 代理人 陸惠中;王永偉
地址 102206北京市昌平區(qū)科技園區(qū)生命園路29號(hào)1幢A301-3室
法律狀態(tài) -

摘要

摘要 本發(fā)明公開(kāi)了一種基于三代測(cè)序平臺(tái)的HLA基因分型方法，包括以下步驟：（1）對(duì)需要分型的HLA基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增；（2）PCR所得產(chǎn)物檢測(cè)合格后，進(jìn)行三代測(cè)序，獲得原始數(shù)據(jù)；（3）將原始數(shù)據(jù)與參考基因序列進(jìn)行長(zhǎng)序列比對(duì)；（4）比對(duì)后對(duì)測(cè)序錯(cuò)誤進(jìn)行矯正；（5）分相得到單體型序列；（6）分型判斷。相比于現(xiàn)有的HLA基因分型方法，本發(fā)明的HLA分型方法對(duì)計(jì)算資源要求少、分型快、分辨率高，對(duì)臨床移植組織配型、群體遺傳學(xué)、人類學(xué)和進(jìn)化學(xué)等應(yīng)用和基礎(chǔ)研究工作具有重要價(jià)值。